BioMCP
Integración de investigación biomédica para IA — consulta PubMed, ensayos clínicos y bases de datos genómicas
data Python Intermedio Auto-hospedable Sin API key
⭐ 300 stars 📅 Actualizado: hace 1m
Descripción
Servidor MCP diseñado para flujos de trabajo de investigación biomédica. BioMCP conecta asistentes de IA con bases de datos biomédicas principales incluyendo PubMed, ClinicalTrials.gov y recursos genómicos. Realiza búsquedas de literatura, descubre ensayos clínicos activos y analiza información de genes y variantes — todo mediante consultas en lenguaje natural. Creado por GenomOncology para investigadores, clínicos y bioinformáticos que quieren acelerar su investigación con recuperación y análisis de datos asistidos por IA.
✅ Ideal para
Investigadores y clínicos que necesitan acceso asistido por IA a literatura y bases de datos biomédicas
⏭️ No recomendado si
Necesitas acceso a bases de datos biomédicas propietarias o institucionales
💡 Casos de uso
- Buscar en PubMed literatura relevante sobre enfermedades o tratamientos específicos
- Descubrir ensayos clínicos por condición, intervención o criterios de elegibilidad
- Consultar información de genes y variantes para investigación genómica
- Construir asistentes de investigación con IA para equipos biomédicos
👍 Ventajas
- ✓ No requiere API key — acceso gratuito a bases de datos biomédicas públicas
- ✓ Cubre múltiples fuentes de datos principales (PubMed, ClinicalTrials.gov, DBs genómicas)
- ✓ Instalación simple con pip en entorno Python
- ✓ Diseñado específicamente para flujos de trabajo de investigación científica y clínica
👎 Desventajas
- ✗ Limitado a bases de datos biomédicas disponibles públicamente
- ✗ Los resultados dependen de la calidad y cobertura de las fuentes de datos upstream
- ✗ Solo Python — requiere un entorno Python
🔧 Herramientas expuestas (5 herramientas)
| Tool | Categoría | Descripción |
|---|---|---|
| get_gene_info | query | Obtener información y anotaciones de genes |
| get_variant_info | query | Consultar detalles de variantes genéticas y patogenicidad |
| search_pubmed | search | Buscar literatura biomédica en PubMed |
| search_clinical_trials | search | Buscar ensayos activos y completados en ClinicalTrials.gov |
| search_literature | search | Búsqueda amplia de literatura en bases de datos biomédicas |
⚡ Instalación
Requisitos previos:
- • python v3.10+
Consulta la documentación de Claude Code para configurar este MCP server.
💡 Consejos y trucos
Instala con pip install biomcp y configúralo como servidor MCP stdio. Combina la búsqueda en PubMed con el descubrimiento de ensayos clínicos para obtener panoramas de investigación completos.
🔄 Alternativas
Info rápida
- Autor
- GenomOncology
- Licencia
- MIT
- Runtime
- Python 3.10+
- Transporte
- stdio
- Categoría
- data
- Dificultad
- Intermedio
- Auto-hospedable
- ✅
- Auth
- —
- Docker
- —
- Versión
- latest
- Actualizado
- 28 feb 2026
Compatibilidad con clientes
- ✅ Claude Code
- ✅ Cursor
- ✅ VS Code Copilot
- ❓ Gemini CLI
- ❓ Windsurf
- ❓ Cline
- ❓ JetBrains AI
- ❓ Warp
Enlaces
Plataformas
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